北京空 军总医院主要承担空 军飞行人员航空病、常见病诊疗防治研究及医学鉴定任务；承担预备航天员的体检选拔任务；承担空 军部队及联勤部队官兵的健康保障和疾病救治；还面向人民群众提供优质医疗服务。已发展成为一所集医疗、教学、科研和预防保健为一体的大型现代化综合性三级甲等医院。
北京空 军总医院学科设置齐全，拥有50多个临床、医技科室，拥有皮肤科、中西医结合正骨科、中医科3个国家中医药管理局重点学科和专科、专病中心，1个全军皮肤病研究所，8个全军医学专科、专病中心，1个国家临床试验机构及全军临床药理基地，设有飞行学员医学选拔中心及一批特色学科。
北京空 军总医院皮肤科“学科”各类技术人员89人，其中正高级职称9人，副高级职称11人，博士19名，硕士14名。是第四军医大学、第三军医大学、解放军总医院、中国医科大学、安徽医科大学、北京中医药大学等院校的研究生培养点，博士后流动站，现有博士研究生导师4名、硕士研究生导师6名。
北京空 军总医院共编设50多个临床、医技科室，展开床位1500多张，年门诊量200多万人次，收治量约4万人次，手术1.8万台次。有空 军级专家3人，空 军高层次科技人才75人。拥有PET-CT、640排CT、高低场核磁、2微米激光腔镜治 疗系统等高 端科研医疗设备。